Оценка ОМЛ, сочетающая генетические и эпигенетические изменения, может помочь в выборе терапии

Результаты, опубликованные в Журнале клинической онкологии, взяты из исследования, проведенного учеными из Онкологического центра Университета штата Огайо – Артуром Дж. Онкологическая больница Джеймса и Ричард Дж. Научно-исследовательский институт Соловья (OSUCCC – Джеймс).
Эпигенетическое изменение, используемое в исследовании, – это метилирование ДНК.

Он включает добавление метильных групп к ДНК, которые могут снизить или заглушить активность или экспрессию гена. Аномальное метилирование ДНК изменяет нормальную экспрессию генов и часто играет важную роль в развитии рака.
В целом, результаты показывают, что пациенты с низким баллом – что указывает на то, что один или ни один из семи генов сверхэкспрессируется в клетках ОМЛ – имели лучшие результаты, и что пациенты с высокими баллами, то есть с шестью или семью генами высоко выражены – имели самые плохие результаты.
«На сегодняшний день классификация заболеваний и прогноз для пациентов с ОМЛ в основном основаны на хромосомных и генетических маркерах», – говорит главный исследователь Клара Д. Блумфилд, доктор медицины, заслуженный профессор университета, ученый-онколог из Университета штата Огайо и старший советник.

"Эпигенетические изменения, влияющие на экспрессию генов, не рассматривались. Здесь мы показываем, что эпигенетические изменения в ранее признанных и прогностически важных мутировавших генах могут идентифицировать новые подгруппы пациентов, что может лучше помочь в выборе терапии », – говорит Блумфилд, который также является председателем отдела исследований рака в штате Огайо Уильямом Гринвиллом Пейсом III.

Панель из семи генов была выявлена ​​у 134 пациентов в возрасте 60 лет и старше с цитогенетически нормальным острым миелоидным лейкозом (CN-AML), которые лечились в рамках клинических испытаний рака и лейкемии группы B (CALGB) / Альянса.
Исследователи рассчитали оценку на основе количества генов в панели, которые были высоко экспрессированы в клетках AML пациентов, и ретроспективно проверили оценку в двух группах пожилых пациентов (возраст 60 и старше) и двух группах более молодых пациентов (возраст 59 лет). и ниже).

Пациенты с низким показателем, свидетельствующим о сверхэкспрессии одного из семи генов или ни одного из них, имели наилучшие результаты. Пациенты с высокими баллами, то есть с шестью или семью генами с высокой степенью экспрессии, имели наихудшие результаты.

«Для этой панели из семи генов чем меньше высоко экспрессируемых генов, тем лучше результат», – говорит первый автор Гвидо Маркучи, доктор медицины, профессор медицины и заместитель директора по трансляционным исследованиям в OSUCCC – Джеймс. «Как у молодых, так и у пожилых пациентов наилучшие результаты имели пациенты, у которых не было высокоэкспрессированных генов или у которых был один высокоэкспрессированный ген."
Большинство взрослых с ОМЛ не излечиваются современными методами лечения. По словам Блумфилда, только около 40 процентов пациентов моложе 60 лет и около 10 процентов пациентов в возрасте 60 лет и старше живы через три года, поэтому необходимы новые стратегии для лечения болезни и для подбора правильного пациента с правильным лечением.

Для этого исследования Блумфилд, Маркуччи и их коллеги использовали секвенирование следующего поколения для анализа участков метилированной ДНК, связанных с прогностически важными генными мутациями в клетках CN-AML у 134 пациентов в возрасте 60 лет и старше.

Исследователи идентифицировали семь генов: CD34, RHOC, SCRN1, F2RL1, FAM92A1, MIR155HG и VWA8. Для каждого из этих генов более низкая экспрессия и более высокое метилирование ДНК были связаны с лучшим результатом. Суммарная оценка была разработана на основе количества генов в панели, показывающих высокую экспрессию. Исследователи подтвердили оценку у четырех групп пациентов: пожилых и молодых пациентов с первичным AML, а также пожилых и молодых пациентов с CN-AML (всего 355 пациентов).

Когда Блумфилд, Маркуччи и их сотрудники применили невзвешенную оценку к исходной обучающей выборке из 134 пожилых пациентов, у тех, у кого был один или не был высоко экспрессируемый ген, уровень полной ремиссии составил 96 процентов, трехлетняя выживаемость без болезней – 32 процента, а показатель выживаемости – 39. процент общей трехлетней выживаемости.
С другой стороны, пациенты с шестью-семью высокоэкспрессированными генами имели 25% полную ремиссию, 0% трехлетнюю выживаемость без болезни и 4% общую трехлетнюю выживаемость.

Для более молодых взрослых пациентов, в возрасте до 60 лет, с одним или отсутствующим высокоэкспрессированным геном показатель полной ремиссии составлял 91-100 процентов, трехлетняя выживаемость без болезней – 60-65 процентов и 76-82 процента – трехлетняя выживаемость. -годовая общая выживаемость. С другой стороны, у пациентов с шестью-семью высокоэкспрессируемыми генами уровень полной ремиссии составлял 53-71%, трехлетняя выживаемость без признаков заболевания – 13-17%, а общая трехлетняя выживаемость – 7-24%. выживание.

«В целом, наши результаты показывают, что невзвешенная сводная оценка является лучшей моделью по сравнению со всеми другими прогностическими маркерами и ранее сообщенными профилями экспрессии генов», – говорит Блумфилд.