База данных геномных вариантов каталогизирует примерно 2.4 миллиона ДНК CNV. Некоторые из них ранее считались причиной самых разных черт и состояний.
Согласно исходной информации в статье большой (определяется как более 500 кб), рецидивирующие CNV были особенно связаны с задержкой развития и умственной отсталостью (характеризующейся ограниченным интеллектуальным функционированием и нарушением адаптивного поведения в повседневной жизни) у лиц с симптомами, выявленных в клинических условиях.
Александр Реймонд, Ph.D., и Катрин Манник, Ph.D., из Университета Лозанны, Швейцария, и его коллеги использовали популяционный биобанк Эстонии, который содержит образцы от 52000 участников, чтобы изучить последствия CNV для предположительно здорового населения. Врачи общей практики обследовали участников и заполнили анкету с вопросами, связанными со здоровьем и образом жизни, а также с установленными диагнозами.
Например, была доступна информация о достигнутом уровне образования участников. Анализ вариантов числа копий был проведен на случайной выборке из 7 877 человек, и были оценены ассоциации генотип-фенотип с образованием и признаками заболевания. Фенотип – это характеристика человека, которая является результатом взаимодействия генетической структуры человека (генотипа) и его или ее окружающей среды.
Из 7877 эстонской когорты исследователи идентифицировали 56 носителей рецидивирующих крупных CNV, связанных с известными синдромами.
Многие из этих людей имели фенотипические особенности, аналогичные симптомам людей, выявленных в предыдущих клинических исследованиях.
Полногеномная оценка редких CNV среднего размера (частота ≤ 0.05 процентов; ≥ 250 кб) идентифицировал 831 носителя (10.5 процентов) в исследуемой выборке населения.
У этой группы носителей увеличилась распространенность умственной отсталости и снизился уровень образования. Одиннадцать из 216 (5.1 процент) носителей делеции не менее 250 т.п.н. и 5.9 процентов носителей дупликации размером не менее 1 МБ имели умственную отсталость по сравнению с 1.7 процентов в эстонской когорте без обнаруженных CNV.
Из носителей делеции 33.5 процентов не окончили среднюю школу, а 39.1 процент носителей дупликации не окончили среднюю школу по сравнению с 25.3 процента населения Эстонии в целом.
Эти доказательства связи между редкими CNV среднего размера и более низким уровнем образования были дополнительно подтверждены анализом когорт, в том числе интеллектуально высокофункциональной группы эстонцев и трех географически различных групп населения в Великобритании, США и Италии.
"Воспроизведение этих результатов в дополнительных группах населения является оправданным, учитывая потенциальные последствия этого наблюдения для исследований в области геномики, клинической помощи и общественного здравоохранения."
От редакции: когнитивные фенотипы и вариации числа копий генома
«Результаты, представленные Манником и др., Показывают, что индивидуально редкие, но коллективно общие CNV среднего размера вносят свой вклад в различия в уровне образования», – пишет Джеймс Р. Лупски, М.D., Ph.D., D.Sc., Медицинского колледжа Бейлора, Хьюстон, в сопроводительной редакционной статье.
"Этот фенотип является объективно поддающимся количественной оценке признаком, который может инициировать заказ геномного исследования, способного выявить CNV, используемую в клинической практике.
С признанием потенциально причинной мутации у человека можно инициировать индивидуальные поведенческие и образовательные мероприятия с пациентами и их членами семьи, которые могут улучшить результаты обучения. Хотя изменение генома человека невозможно, выявление людей с CNV, связанными с когнитивными фенотипами, может дать возможность помочь им полностью реализовать свой потенциал."