V (D) J recombinase, фермент редактирования, что создаёт определенные рецепторы на поверхности иммуноцитов, каковые соответствуют зарубежным захватчикам, коллективно названным антигенам, может иногда пропускать собственную цель. Лаборатория ведущего автора Дэвида Рота, Мэриленд, доктора философии, Лабораторной Отдела Медицины и председателя Патологии, разрабатывала связанную с раком запутанность V (D) J recombinase в течение прошлых двух десятилетий. «Лучшее знание нецелевых неточностей имело возможность привести к более надёжным предположениям инструментов генной инженерии», сообщил Рот.
V (D) J recombinase трудится лишь на протяжении ранних стадий созревания иммуноцита. От данной сцены в костном мозге разнообразное множество рецепторов и антител поверхности клеток, обнаруженных свободных клетках B и клетках T, соответственно, сделано противодействовать всем зарубежным захватчикам столкновения людской тела.Перерывы в нитях ДНК, которые связаны с V (D) J сокращение, в большинстве случаев восстанавливаются с высоким качеством совершенно верно настроенным молекулярным оборудованием. Прошлые изучения из лаборатории Рота продемонстрировали, что V (D) J recombinase (складывающийся из RAG1 и белков RAG2) в большинстве случаев отправляет паузу в ДНК вниз верный путь ремонта, предотвращая доступ к второму, несоответствующим механизмам ремонта.
Данный процесс выпаса возможно отключен, в случае если «C» конечная остановка подъединицы белка RAG2 удалена. Это вызывает геномную нестабильность в развитии иммуноцитов и, в отсутствие рабочего белка подавителя опухоли, таких как p53, агрессивная форма лимфомы начинается у мышей.
Геном широкий анализ лимфом тимуса у этих мышей с усеченным белком Rag2 продемонстрировал удивление: бессчётные нецелевые перестановки ДНК, приводя к, отметили Рота. Прошлая работа высказала предположение, что разная неточность – перемещения хромосомы либо обмены между двумя хромосомами – имела возможность бы лежать в базе развития лимфомы у этих мышей, но целого генома, упорядочивающего продемонстрированные удаления как главные драйверы этих раковых образований.
Эти перестановки затронули пара известных и генов и подозреваемых онкогенов-супрессоров опухоли, включая Notch1, Pten, Ikzf1, Jak1, Phlda1, Trat1 и Agpat9.Анализ Genomewide отметок хроматина кроме этого высказал предположение, что обычные сотрудничества между C-конечной-остановкой подъединицы белка Rag2 и определенной модификацией хроматина оказывают помощь поддержать точность целевого признания ДНК ферментом. Экспрессия гена отрегулирована эпигенетическими химическими модификациями (включая methylation и acetylation) на хроматине – белки гистона, хорошо связанные с ДНК. Определенные химические группы на гистонах разрешают ДНК раскрываться, и другие, дабы сжать хроматин, и так создавая доступность, которая будет прочтена и выражена как белки.
Помимо этого, говорят исследователи, вызывающие рак эффекты нецелевых удалений, по неточности созданных V (D) J фермент, необходимо разглядеть в проектировании определенных для места ферментов для модификации генома, таких как нуклеазы цинкового пальца, TALENS либо CRISPRs.