В частности, исследователям удалось извлечь более 400 белков из нейронов височной коры головного мозга, что намного больше, чем было извлечено ранее. Исследование будет опубликовано 21 октября в журнале Scientific Reports (Nature).
«Этот новый метод позволяет более точно исследовать сохраненные формалином ткани из сотен банков мозга по всему миру и имеет особое значение при изучении патогенеза болезни Альцгеймера и других нейродегенеративных заболеваний», особенно для исследования, – говорит старший научный сотрудник исследования. Томас Вишневски, доктор медицины, директор Центра когнитивной неврологии Нью-Йоркского университета в Лангоне и Лулу П. и Дэвид Дж. Левидов профессор неврологии и профессор патологии и психиатрии Медицинской школы Нью-Йоркского университета. «Раньше для таких исследований требовалась замороженная ткань."
В исследовании использовалась ткань, пропитанная воском и вырезанная для анализа, так называемая фиксированная формалином ткань, залитая парафином (FFPE). Лаборатории патологии в больницах обычно собирают этот вид ткани, и он доступен недорого и в больших количествах.
Клеточно-специфическая протеомика
Исследователи использовали метод, известный как микродиссекция с лазерным захватом, для подсчета сотен белков в определенной группе нейронов, изолированных от ткани в областях размером с отдельные клетки.
Содержание белка осталось неизменным.
До сих пор метод FFPE затруднял изучение белков на клеточном уровне. Исследователей также беспокоит деградация белков при работе с тканями. Однако, осознавая, что нерастворимые группы белков являются признаком болезни Альцгеймера и других нейродегенеративных заболеваний, команда собрала дополнительные образцы нейронов из клеток, используя муравьиную кислоту, чтобы сделать ткань растворимой.
«Фиксированных формалином тканей, залитых парафином, очень много», – говорит д-р. Вишневски. «Мы считаем, что этот метод относительно прост, воспроизводим и предлагает высокочувствительный метод обнаружения белков. Он предложит исследователям новый важный инструмент для изучения белков с использованием очень малых объемов заархивированной ткани."