Заболевание изменяет экспрессию молекул РНК и белков в тканях. Микроскопические исследования образцов тканей обычно проводятся в лабораториях и больницах в интересах углубления знаний и диагностики, но на сегодняшний день возможно одновременное определение местоположения лишь небольшого числа молекул РНК.
Сотрудничество профессоров Йонаса Фрисена (KI) и Йоакима Лундеберга (KTH) в SciLifeLab привело к новому методу, который позволяет анализировать количество всех молекул РНК и предоставляет пространственную информацию с микроскопа.
«Поместив срезы тканей на предметное стекло, на которое мы поместили нити ДНК со встроенными адресными метками, мы смогли пометить молекулы РНК, образованные активными генами», – говорит профессор Фризен. «Когда мы анализируем присутствие молекул РНК в образце, адресные метки показывают, где в секции находились молекулы, и мы можем получить информацию с высоким разрешением о том, где активны различные гены.”
Результаты также важны для более точной диагностики.
Текущая практика состоит в том, чтобы взять образец ткани, измельчить его и проанализировать смесь клеток, но существует риск того, что несколько раковых клеток станут настолько разбавленными сигналами от всех других клеток в образце и, следовательно, будут упущены из виду.
«С помощью нашего метода мы можем уловить сигнал опухоли, поскольку он не разбавлен», – продолжает он. «Поскольку разные части образца ткани имеют свои специфические адресные метки, мы можем идентифицировать небольшое количество опухолевых клеток.”
Метод может применяться на всех типах тканей и при заболеваниях. Он также может предоставить информацию о неоднородности заболевания в диагностике рака, как показано в исследовании рака груди.
Как вы надеетесь, что ваш метод приведет к?
«Это позволяет изучать, какие гены активны в тканях, с большей разрешающей способностью и точностью, чем когда-либо прежде, что важно как для фундаментальных исследований, так и для диагностики», – говорит профессор Фризен.
Исследование финансировалось за счет грантов Фонда Кнута и Алисы Валленберг, Шведского фонда стратегических исследований, Шведского исследовательского совета, Шведского общества, Каролинского института, Фонда Тобиаса, Фонда Торстена Содерберга, Фонда Рагнара Содерберга, StratRegen ( область стратегических исследований в области исследования стволовых клеток и регенеративной медицины в KI), Фонд Аке Виберга и Фонд Жанссона.