Разочарованная такой ситуацией, международная группа исследователей представляет функцию поиска в базе данных UNITE для молекулярной идентификации грибов. Его цель – выделить грибы, о которых мы знаем меньше всего, и предложить научному сообществу определить их таксономическую принадлежность. Эта работа направлена на устранение значительного пробела в знаниях между таксономией грибов и молекулярной экологией с помощью списка, который авторы называют «50 самых разыскиваемых грибов»."Их работа представлена в новой исследовательской статье, опубликованной в журнале с открытым доступом MycoKeys.
Формально описано около 100000 видов грибов, хотя по текущим оценкам количество существующих видов грибов составляет не менее 6 миллионов. Очевидно, что нет недостатка в исследовательских центрах по изучению грибов, но есть и другие недостатки? Огромное разнообразие темных грибов, раскрытое с помощью молекулярных методов, намекает на то, что взаимодействие между таксономией грибов и секвенированием ДНК экологических субстратов, таких как почва и вода, не обязательно оптимально.
«Не существует таксономической петли обратной связи, чтобы подчеркнуть присутствие этих загадочных линий для микологического сообщества, и они часто попадают в базы данных последовательностей в течение многих лет, не вызывая значительного исследовательского интереса», – объясняют авторы. "Фактически, более 10 лет в некоторых случаях."
Поэтому исследователи во главе с доктором Хенриком Нильссоном из Гетеборгского университета теперь представляют функцию поиска, которая создает списки кластеров последовательностей ДНК грибов приблизительно на уровне рода, о таксономической принадлежности которых нам почти ничего не известно. Эти списки пересчитываются ежемесячно с учетом любых обновлений и дополнений, внесенных научным сообществом между каждой итерацией. Приветствуется участие сообщества, а база данных UNITE имеет обширную поддержку сторонних аннотаций.
Обращая внимание на эти грибковые линии, д-р Нильссон и его коллеги надеются ускорить изучение и формальное описание основных видов. Для поддержки исследователей, специализирующихся на избранных группах грибов или средах, предоставляется набор списков, отфильтрованных по ключевым словам.
Это позволяет исследователям увеличивать масштаб неизвестных грибов, извлеченных, например, из искусственной или водной среды обитания.
Комментируя свой выбор названия для списка, исследователи уточняют, что лежащие в основе грибы не виновны ни в каком преступлении. "Действительно, ничего нельзя сказать о том, как они зарабатывают на жизнь. Это просто не известно.
Мы не претендуем на важность этих грибов с какой бы то ни было точки зрения – экологической, экономической или иной », – подчеркивают они. «Тем не менее, мы заявляем об их уникальности, потому что в 2016 году нас разочаровывает отсутствие возможности присвоить имя последовательности грибов даже на уровне филума."
«Мы надеемся, что настоящая публикация поможет привлечь внимание к этим неизведанным частям грибного древа жизни, и мы приглашаем читателя изучить их с помощью наших онлайн-инструментов или иным образом», – заключают они.