Ученые из Флоридского кампуса Исследовательского института Скриппса (TSRI) обнаружили, как кофактор фермента может придавать специфичность классу белков с неспецифической биохимической активностью.
Рассматриваемый белок помогает в сборке рибосом, больших макромолекулярных машин, которые имеют решающее значение для производства белка и роста клеток.
Это новое открытие расширяет взгляд ученых на роль кофакторов и предполагает, что такие кофакторы могут быть использованы для изменения активности родственных белков и их роли в заболевании.
«При производстве рибосом вам нужно действовать очень конкретно», – сказала доцент TSRI Катрин Карбштейн, руководившая исследованием. "Добавление кофактора, такого как Rrp5, заставляет эти ферменты проявлять специфичность в своих действиях.
Очевидная возможность состоит в том, что, если вы можете манипулировать кофактором, вы можете изменить активность белка, что может оказаться чрезвычайно важным."
Новое исследование, которое публикуется на неделе 29 апреля 2013 г. в онлайн-выпуске «Слушаний Национальной академии наук», проливает свет на белки, называемые белками DEAD-box, провокационное название, фактически полученное из их аминокислот. последовательность. Эти белки регулируют все аспекты экспрессии генов и метаболизма РНК, особенно в производстве рибосом, и участвуют в метаболизме клеток. Связь между дефектами сборки рибосом и раком, а также между белками DEAD-бокса и раком хорошо задокументирована.
Полученные данные показывают, что DEAD-бокс-белок Rok1, необходимый для производства небольшой рибосомальной субъединицы, распознает основу РНК, основную структурную основу нуклеиновых кислот. Затем кофактор Rrp5 дает Rok1 возможность воздействовать на конкретную последовательность РНК, модулируя структуру Rok1.
«Несмотря на обширные усилия, роль этих белков DEAD-бокса в сборке двух рибосомных субъединиц остается в значительной степени неизвестной», – сказал Карбштейн. "Наше исследование показывает, что решение может заключаться в том, чтобы сначала определить их кофакторы."