Секвенирование следующего поколения позволяет понять, как виды приспосабливаются к изменению климата

В статье, которая будет опубликована в мартовском номере BioScience, биологи Джонатон Х. Стилман и Эрик Армстронг, оба из Государственного университета Сан-Франциско и Калифорнийского университета в Беркли, характеризуют возможности, предоставляемые NGS: «Подходы к секвенированию следующего поколения коренным образом меняют способ, которым ученые-экологи проводят исследования, чтобы понять, как реагируют организмы. или может отреагировать в будущем на изменение климата.Кроме того, авторы утверждают, что NGS позволит исследователям «охарактеризовать популяции, которые они изучают, с более высоким разрешением, чем когда-либо прежде."
Одна из важных особенностей NGS заключается в том, что биологи-экологи могут оценить наличие или отсутствие определенных вариантов генов в местных популяциях, которые могут указывать на выбор по определенным адаптированным к климату признакам.

Изменения в экспрессии генов также доступны через NGS и предоставляют дополнительную информацию об ответах населения. Например, в исследовании кораллов NGS исследователи обнаружили, что гены, связанные с клеточными реакциями на стресс, подавлялись в популяции, адаптированной к теплу. По словам Стиллмана и Армстронга, подавление генов CSR «согласуется с доказательствами, свидетельствующими о том, что поддержание повышенных уровней экспрессии этих генов связано с эволюционной ценой».

Несмотря на обещания NGS, его использование для изучения реакции на изменение окружающей среды может быть затруднено из-за отсутствия финансирования. По сравнению со своими коллегами в области медицины и агробизнеса, биологи-экологи получают меньше финансирования, а NGS стоит дорого. По словам авторов, «широкое внедрение подходов NGS биологами-экологами потребует нового мышления о том, как финансировать исследователей или исследовательские консорциумы, которые пытаются использовать лучшие доступные инструменты для решения того, что может быть одним из крупнейших, но наиболее плохо финансируемых. проблемы, стоящие перед обществом сегодня – понимание и смягчение последствий изменения климата."