CRISPR-Cas9 – революционная техника для редактирования геномов и до недавнего времени, большая часть изучений, применяющих его, было нацелено на глушение кодирующих белок генов, оптимальнее изученной части отечественного генома. Но, отечественный геном складывается из 99% ДНК, которая не кодирует белка. Довольно часто обрисовываемый как «Чёрная материя» генома, эта «некодирующая ДНК», как признают, кардинально серьёзна для понимания всех качеств людской биологии, включая эволюцию и болезнь.Лаборатория Джонсона сравнительно не так давно создала инструмент на базе CRISPR-Cas9, названного «ДЕКО», что может употребляться, дабы удалить любую желаемую часть некодирования ДНК.
Неповторимое преимущество ДЕКО пребывает в том, что это применяет два отдельных sgRNAs, действуя как два «молекулярных ножниц», каковые отрезают кусок ДНК. Подход был обширно принят, но потому, что никакое ПО не было доступно для проектирования пар sgRNAs, каковые требуются, проектирование опытов удаления было отнимающим большое количество времени.В ответ на это, исследователей в этом изучении во главе с Карлосом Пулидо, создал трубопровод ПО называющиеся CRISPETa, эластичное ответ для проектирования опытов удаления CRISPR.
Пользователь говорит CRISPETa, какой регион они желают удалить, и прибыль ПО последовательность оптимизированных пар sgRNAs, каковые смогут конкретно употребляться экспериментальными исследователями. Одна из основных изюминок – то, что это может создать проекты в высоких весах с будущими опытами показа в памяти.Исследователи продемонстрировали, что проекты CRISPETa действенно удаляют собственные желаемые цели в клетках человека. Самое основное, в тех регионах, каковые дают начало молекулам РНК, исследователи продемонстрировали, что молекулы РНК кроме этого несут удаление.
«В конечном итоге мы ожидаем, что удаление CRISPR и другие инструменты разработки генома, дабы привести к революции в отечественной способности осознать геномное основание заболевания, в особенности в 99% ДНК, которая не кодирует белки. Помимо этого, дабы быть применяемым в качестве инструмента фундаментального изучения, CRISPR может кроме того употребляться в будущем в качестве сильного терапевтического, дабы всецело поменять вызывающие заболевание мутации», додаёт Рори Джонсон.CRISPETa создан для применения неспециалистами так, дабы это могло быть полезно для научных исследователей из кроме того самой скромной экспериментальной лаборатории.
Эти пользователи смогут, к примеру, удалить подозреваемую функциональную область некодирования ДНК и проверить итог на клеточной либо молекулярной деятельности. Это ПО кроме этого будет возможно полезно для групп, стремящихся применять удаление CRISPR в терапевтических целях, к примеру, удаляя область некодирования ДНК, которая, как подозревают, приводит к болезненному состоянию.
«Мы сохраняем надежду, что это новое программное средство разрешит самому солидному числу исследователей применять силу удаления CRISPR в их изучении», говорит Карлос Пулидо, студент, что написал ПО CRISPETa.