Количественный анализ пространственного распределения в изображениях с использованием мозаичной сегментации и оптимизации двойных параметров в гистограммах: благодаря такому обширному названию QuASIMoDOH был задуман в Bio Imaging Core Leuven, центре VIB, посвященном самым современным услугам и инструментам для микроскопии. для анализа изображений с высоким разрешением. Разработкой руководил проф. Себастьян Мунк, эксперт-технолог VIB, в тесном сотрудничестве с исследователями VIB-KU Leuven.
Учет разнообразия клеток
Конкретная потребность лежала в основе разработки QuASIMoDOH. Ученые из Bio Imaging Core изо всех сил пытались количественно оценить распределение рецепторов на клеточной мембране. Хотя уже существует довольно много статистических инструментов, которые можно использовать для изучения состава мембраны, многие из них сосредоточены только на кластерах белков и липидов. Чтобы собрать всю сложность биологических образцов, проф.
Мунк и его команда решили сами разработать новый метод.
Проф. Мунк (VIB-KU Leuven): «Наш подход описывает пространственные структуры мембранных белков и липидов с точки зрения отклонения от случайного распределения. Основное отличие состоит в том, что QuASIMoDOH может отображать полярные распределения, а это означает, что неравные распределения, такие как градиенты, могут быть проанализированы.
Тот факт, что наш метод совместим с различными типами характеристик клеточного структурирования, включая полярность, имеет огромное значение. Например, прогрессирование рака характеризуется рядом изменений, происходящих внутри клеточной мембраны, включая изменения полярности. QuASIMoDOH позволяет нам изучить и понять эти изменения."
Объединение усилий против болезней
Эти изменения вызывает не только рак – многие другие заболевания, а также процесс старения могут влиять на состав мембран. Bio Imaging Core планирует использовать технологию QuASIMoDOH для поддержки исследователей – как внутри, так и за пределами VIB-KU Leuven – с проверками в различных областях, от нейробиологии до исследований рака. Именно поэтому команда разработчиков уделила особое внимание доступности инструмента: он совместим с различными микроскопическими технологиями и имеет довольно простое считывание.
Доктор. Герт Ван Миннебругген (руководитель основных производственных мощностей VIB): «Подобные инновационные инструменты являются результатом объединения технологических и научных знаний.
На основных объектах VIB, включая Bio Imaging Core, опытные технологи, такие как Себастьян Мунк, уже некоторое время объединяют усилия с руководителями исследовательских групп. Понятно, что совместное использование технологического оборудования и ноу-хау становится предпосылкой для научных открытий."