Подавляющее большинство противоинфекционных средств, представленных сегодня на рынке, представляют собой натуральные бактериальные продукты, созданные с помощью кластеров биосинтетических генов. Секвенирование генома бактерий показало, что количество этих активных кластеров генов примерно в десять раз превосходят так называемые молчащие кластеры генов.
«Включение этих кластеров действительно расширит наше доступное химическое пространство для поиска новых антибиотиков или других терапевтически полезных молекул», – сказал Сейедсаямдост.
В статье, опубликованной в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences, Сейедсаямдост сообщил о стратегии быстрого скрининга целых библиотек соединений для поиска элиситоров, небольших молекул, которые могут включать определенный кластер генов.
Он использовал генетический репортер, который флуоресцирует или генерирует цвет при активации кластера генов, чтобы легко идентифицировать положительные результаты. С помощью этого метода были успешно активированы два молчащих кластера генов и был обнаружен новый метаболит.
Применение этой работы обещает открыть новые бактериальные натуральные продукты и дать представление о регуляторных сетях, которые контролируют кластеры молчаливых генов.