«Изучение, каждая совокупность требует знания, из чего сделана совокупность», говорит Бозилджка Тэзик, врач философии, ассистент Инвестигэтор в Университете Аллена Мозговой Науки. «Имеется большое количество способов выяснить клеточные стандартные блоки мозга. Отечественный подход должен был взглянуть на все гены, каковые выражены в отдельных клетках в зрительной территории коры головного мозга мыши и применяют те данные, дабы классифицировать клетки».
Команда развивала технику, дабы изолировать единственные клетки от взрослого мозга мыши, и после этого получила информацию об экспрессии гена всего генома из этих отдельных клеток. Любая клетка высказывает тысячи генов, делая проблему классификации клеток огромной вычислительной задачей.«Первоначально, неприятность классификации клеток похожа на Кегли сортировки в темноте», говорит Вилас Мянон, Ученый II в Университете Аллена Мозговой Науки. «С данными об экспрессии гена единственной клетки мы приобретаем эквивалент цвета, либо тип, данные, но мы все еще должны извлечь его из широкомасштабного комплекта данных.
В конечном итоге мы желали узнать какое количество типов, в том месте были беспристрастным, управляемым данными методом».Tasic, Menon и их команда применяли вычислительные способы сокращения измерения, каковые разрушаются гены с подобным характером экспрессии в генные комплекты. В то время, когда единственные клетки были проанализированы, группируясь в этом более низко-размерном космосе, 49 хороших групп показались на базе неповторимых комбинаций генов, каковые они высказывают, включая 42 нейронных типа клетки и 7 ненейронных типов.«Отечественная людская кора – то, что дает начало отечественным восприятию и уникальным мыслям», говорит Кристоф Кох, врач философии, президент и Основной Научный сотрудник в Университете Аллена Мозговой Науки. «Наличие этого вида объективного анализа типов клетки в данной области мозга есть главной частью понимания, что нам необходимо, и снабжает основание для рассмотрения вторых областей мозга мыши и кроме этого в людской мозгу».
Эти из этого единственного аналитического подхода клетки соглашаются с и дополняют Атлас Аллена Брэйна: атлас экспрессии гена всего мозга мозга мыши.«Отечественное отделение анализа было всеми генами и единственной клеткой в каждой клетке, но в отечественном ходе, мы утратили красивую пространственную данные», говорит Тэзик. «Но тогда, мы смогли применять отечественный Атлас Аллена Брэйна, у которого имеется анализ всего мозга каждого гена, один ген за один раз в клеточной резолюции, дабы более определить местонахождение каждого типа клетки. Отечественная работа – еще один ход к назначению генов к определенным типам клетки, и после этого помощь исследуют то, что делают эти гены, как они сотрудничают, и как они в конечном итоге делают отечественные нервные совокупности и нас, каковые мы».
«Категоризация клеток в зрительной территории коры головного мозга в эти хорошие типы, каковые отмечены определенными генами, разрешит нам начать осознавать то, что типы и эти клетки делают в мозгу», говорит Хункюй Цзэн, врач философии, Следователь Генетики Cell и Схемы в Университете Аллена Мозговой Науки. «После этого, мы можем заняться расследованиями, как экспрессия гена коррелирует с анатомическими, физиологическими и функциональными особенностями клеток, как эти типы клетки связаны между собой, и как они сотрудничают, дабы обработать и осознать визуальную данные, которую мозг приобретает от внешнего мира. Это в конечном итоге прольет свет на внутренние работы мозга».