Команда Structural Computational Biology Group испанского Национального Центра Изучений рака (CNIO), возглавляемый Альфонсо Валенсией, вице-директором Центра по Фундаментальному изучению, применяла сетевую теорию выстроить и изучить первую коммуникационную сеть между компонентами, каковые составляют, это геномное образовывает, известный как эпигеном. Заключения были изданы сейчас в издании Cell Reports.Epigenomics: включение генов либо OffF
Отметки Epigenomic смогут принимать во внимание группой выключателя, которая определяет, какие конкретно части генома включены и будут видимы к клетке. Следовательно, та же самая генетическая информация, находившаяся во всех клетках живого существа, может произвести много разных типов клетки, применяя определенные гены и игнорировав вторых.
Дабы изучить данный нюанс в большей глубине, исследователи собрали эти от литературы, каковые включают 3 химических модификации в цитозин (письмо «C» от ДНК), 13 модификаций гистонов (белки, около которых ДНК обернута), и 61 белок, который связан с ДНК, от эмбриональных стволовых клеток мыши.Авторы обращаются, математические методы раньше измеряли влияние и популярность веб-сайтов (таких как Википедия либо Facebook) к сети epigenomic коммуникации. Они сделали вывод, что 5hmC отметка (химическая модификация цитозина с hydroxymethyl группой в положении 5′) есть самым влиятельным компонентом данной сети в стволовых клетках.5hmC как Центр«Мы приблизились к системной биологии, изучив сигналы хроматина [ДНК с белками и химическими модификациями, каковые связывают с ним] как всесторонняя совокупность, и от этого мы выстроили первую коммуникационную сеть между этими сигналами», говорит Дэниел Рико, исследователь CNIO, что направил изучение вместе с Валенсией. «В этом случае мы говорим о совокупности внутренней связи в каждой клетке, более определенно в ядре».
Как обрисовано в газете, 5hmC действует как главный сигнал, что соединяется с комплексами, каковые изменяют цитозины и гистоны, дабы отрегулировать экспрессию гена. При помощи этих связей, 5hmC регулирует трансформации в уплотнении хроматина, клеточных процессах дифференцирования и энергетическом метаболизме в эмбриональных стволовых клетках.Одновременно с этим филогенетические изучения, проводимые для белков в сети кроме этого, показывают на 5hmC как центр скоординированной эволюции либо коэволюции, этих связанных с хроматином белков.Следующий ход обязан установить, смогут ли результаты кроме этого быть назначены на другие типы клетки. «Мы знали, что 5hmC очень изобиловало эмбриональными стволовыми клетками, но сейчас мы кроме этого знаем, что это правильно для других типов клетки, таково как нейроны либо определенные опухоли», утверждают авторы статьи.
И они додают: «У раковых клеток имеется особенности стволовой клетки; исходя из этого думается уместным заняться расследованиями, смогут ли эти результаты кроме этого быть переданы эпигеномам рака, каковые обеспечили бы новые взоры на то, как они отрегулированы».