GenSeq: обновленная номенклатура генетических последовательностей для решения проблем с таксономической детерминацией

Использование генетических последовательностей увеличивается с каждым годом, но, к сожалению, разделение между ваучерными образцами и генетическими последовательностями также увеличивается. Все чаще не сообщается о связи между генетическими последовательностями, используемыми в анализах, и организмами, от которых они произошли. Таксономическое определение остается исключительной ответственностью подателя последовательностей.

Ошибочные идентификации трудно обнаружить, а сохранение ошибки при последующем использовании данных последовательности практически невозможно остановить.
В новой номенклатуре генетические последовательности помечены как «genseq», за которыми следует рейтинг надежности (e.грамм., 1, если последовательность относится к первичному типу), за которым следует имя генов, от которых были получены последовательности (e.грамм., genseq-1 16S, COI).

Пронумерованный суффикс указывает на вероятную надежность таксономической идентификации ваучера. В эту систему ранжирования в порядке убывания таксономической надежности включены следующие: последовательности из первичных типов – «genseq-1», вторичных типов – «genseq-2», топотипы, подтвержденные коллекцией – «genseq-3», «нетипы с ваучером на коллекцию -« genseq-4 »и не типы, у которых нет ваучеров на образцы, но есть ваучеры на фотографии -« genseq-5 »."
Чтобы продемонстрировать использование новой номенклатуры, авторы исследования рассматривают недавно опубликованные описания новых видов в ихтиологической литературе, которые включают данные ДНК и применяют номенклатуру GenSeq к последовательностям, на которые есть ссылки в этих публикациях.

«Использование новой номенклатуры и системы ранжирования улучшит интеграцию молекулярной филогенетики и биологической таксономии и повысит способность исследователей оценивать надежность данных о последовательностях», – объясняет один из авторов Др. Просанта Чакрабарти, Музей естественных наук, Университет штата Луизиана. "Мы также рекомендуем авторам обновлять информацию о последовательностях в базах данных, таких как GenBank, всякий раз, когда вносятся номенклатурные изменения."

4 комментария к “GenSeq: обновленная номенклатура генетических последовательностей для решения проблем с таксономической детерминацией”

  1. Green Giant

    Странствовал в интернете и попал в это место. Какое отличное сверхизобретение людей. При помощи мобильной сети беседуешь, исследуешь, разбираешь … Вот уж и с вами лично познакомился.

Оставьте комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован.