Не все исследователи сходятся во мнении о роли Yersinia pestis во второй пандемии чумы, которая произошла с 14 по 17 века. Некоторые предполагают, что это могло быть результатом вирусного заболевания; однако самые последние исследования древней чумы показывают, что смертельная болезнь существовала на тысячи лет раньше, чем считалось ранее. В этом исследовании ученые восстановили и проанализировали древнюю ДНК 30 жертв второй пандемии чумы. Они были раскопаны в двух разных захоронениях в Германии и насчитывают более 300 лет.
Из 30 протестированных скелетов восемь были положительными на нуклеиновую кислоту, специфичную для Yersinia pestis. Генетический материал всех положительных индивидуумов был очень похож на ранее исследованных жертв чумы из других европейских стран и имел идентичные Y. генотип pestis.
Автор предполагает, что помимо предполагаемого непрерывного реинтродукции Y. pestis из Центральной Азии в несколько волн во время второй пандемии, также возможно, что Y. pestis долгое время сохранялся в Европе в еще неизвестном резервуаре-хозяине.