Команда под руководством исследователя из Калифорнийского университета в Санта-Крузе Джима Кента в течение прошедшей недели работала круглосуточно, общаясь с международными партнерами, чтобы собрать и представить самые свежие данные. Браузер вируса Эбола сопоставляет пять штаммов вируса Эбола с двумя штаммами родственного вируса Марбург. В рамках этих штаммов Кент и другие члены команды браузера генома Калифорнийского университета в Санта-Крус выровняли 148 отдельных вирусных геномов, в том числе 102 из текущей вспышки в Западной Африке.
Калифорнийский университет в Санта-Крузе создал портал генома UCSC по вирусу Эбола (http: // genome.UCSC.edu / ebolaPortal /), со ссылками на новый браузер генома Эбола, а также на всю соответствующую научную литературу по этому вирусу.
«Эбола была одним из моих самых больших опасений с тех пор, как я узнал об этом на моем первом уроке микробиологии в 1997 году», – сказал Кент, который 14 лет назад создал первый рабочий проект генома человека. "Нам нужны героические усилия всего мира, чтобы сдержать лихорадку Эбола. Создание информационного ресурса, такого как браузер генома, для исследователей Эболы – меньшее, что мы могли бы сделать."
Ученые со всего мира могут получить доступ к браузеру с открытым исходным кодом, чтобы сравнить генетические изменения в геноме вируса и областях, где он остается неизменным. Браузер позволяет ученым и исследователям из фармацевтических компаний, других университетов и правительств изучать вирус и его геномные изменения, ища решение, чтобы остановить эпидемию.
Выпуск нового браузера генома Эболы происходит как U.S. Центры по контролю и профилактике заболеваний во вторник подтвердили первый случай заболевания Эболой в США.
Браузер на Эбола был запущен вскоре после телефонного разговора между Кентом и его сестрой, эпидемиологом CDC, которая рассказала о том, как она и ее сотрудники были поглощены исследованиями Эболы перед лицом нарастающего кризиса. Профессор Калифорнийского университета в Санта-Крузе Фил Берман, специалист по ВИЧ, также обратился к Кенту за помощью в его усилиях по разработке вакцины от Эболы.
Кент спросил своего руководителя, исследователя биоинформатики Калифорнийского университета в Санта-Крузе Дэвида Хаусслера, может ли он отвлечь свою команду на работу с Эболой. Хаусслер с энтузиазмом ответил утвердительно, и они собрали команду ученых-биоинформатиков Калифорнийского университета в Санта-Крус, которая в течение недели смогла создать полнофункциональный браузер генома вируса Эбола.
«Невероятная скорость, с которой эта группа смогла собрать всю генетическую информацию об Эболе и сделать ее доступной для всего мира, показывает, какую замечательную команду собрал Джим Кент», – сказал Хаусслер.
В июне 2000 года Кент и Хаусслер опубликовали в Интернете первый рабочий проект последовательности генома человека.
Два месяца спустя Кент разработал браузер генома UCSC, который стал важным ресурсом для биомедицинской науки.
Подобным образом объединяя силы перед лицом всемирной угрозы 11 лет назад, исследователи Калифорнийского университета в Санта-Крус создали браузер вирусов SARS.