На большинство селекционных характеристик влияет не один, а множество вариантов. Поэтому важно иметь возможность использовать все варианты в селекции, говорят исследователи Вагенингена. Чтобы сделать это возможным, Рианна ван Бинсберген, доктор философии в Центре селекции и геномики животных в Вагенингене, UR, исследовала, можно ли заполнить геномы всех обычных быков в Нидерландах с помощью этих 234 быков. В настоящее время эти быки генотипированы по маркерам 50 000 или 700 000 вариантов ДНК.
Положительные результаты указывают на направление дальнейших исследований практического использования информации генома в селекции.
Молочный и мясной скот Проект демонстрирует, насколько полезными могут быть крупномасштабные анализы ДНК, – говорит профессор Роэль Веркамп, профессор числовой генетики в Университете Вагенингена и член правления проекта «1000 Bull Genomes». Он подчеркивает, что требования к молочному и мясному скоту становятся все более высокими: «До середины девяностых корова в первую очередь должна была давать много молока.
Но с тех пор ожидания выросли. Фермеры ищут более крепких коров.
На практике это означает хорошую фертильность, более долгую жизнь, вымя, обеспечивающее хорошую защиту от инфекций, улучшенные когти и более эффективное использование корма. Это складывается из множества характеристик, которыми управляют все виды генов. Для того чтобы свести их вместе в корове самым лучшим и быстрым способом, геномный отбор важен для племенных организаций, таких как CRV, и с помощью анализа генома мы хотим улучшить этот процесс », – говорит Виркамп.
Геном быка Геном быка состоит из 3 миллиардов «букв».
У 234 изученных быков исследователи обнаружили в общей сложности более 28 миллионов позиций в ДНК, которые отображали вариации, другими словами, где животные имели разные буквы. В настоящее время CRV использует приблизительно 50 000 вариантов, так называемые однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) для геномной селекции, путем связывания паттернов SNP очень большого числа животных с характеристиками, которые важны для устойчивости. Вместе с CRV и другими партнерами по программе Breed4Food исследователи изучают, может ли новая информация о геноме помочь еще лучше предсказать, какими характеристиками будет обладать потомство.
Представленный сейчас анализ быков является первой фазой проекта «1000 геномов быков», базы данных, в которую планируется включить геномы тысячи быков со всего мира.
На сегодняшний день проанализированы быки в основном из Австралии, Нидерландов, Германии и Франции. «Однако сейчас вовлечено гораздо больше стран, и мы уже превысили 1000 быков», – говорит профессор Веркамп.