Новые функции для ДНК ‘барахла’?

Мы сейчас знаем, что у некодирования ДНК смогут быть ответственные функции не считая кодирования белков. Большое количество некодирующих последовательностей создают молекулы РНК, каковые регулируют экспрессию гена, включая и выключая их. Другие содержат усилитель либо запрещающие элементы. Недавняя работа интернациональным КОДИРУЕТ (Энциклопедия Элементов ДНК), Проект высказал предположение, что у громадного процента некодирования ДНК, которая образовывает примерно 95% генома человека, имеется функция в регуляции генов.

Так преждевременно заявить, что у ДНК «барахла» нет функции – мы легко должны определить, каково это!Дабы оказать помощь осознать важность этого громадного количества некодирования ДНК на фабриках, Дайан Берджесс и Майкле Фрилинге в Калифорнийском университете, Беркли выяснил бессчётные сохраненные некодирующие последовательности (CNSs) ДНК, каковые отысканы в громадном разнообразии видов растений, включая рис, банан и какао. У последовательностей ДНК, каковые высоко сохранены, означая, что они аналогичны либо практически так во множестве организмов, возможно, будут серьёзные функции в главных биологических процессах.

К примеру, генетический код рибосомная РНК, главная часть синтезирующего белок оборудования, нужного клеткам всех организмов, высоко сохранен. Трансформации в последовательности данной главной молекулы не хорошо допускаются, так, рибосомные последовательности РНК поменяли довольно мало более чем миллионы лет эволюции.Дабы выяснить самый высоко сохраненный завод, CNSs, Burgess и Freeling сравнили геном (одна копия всей ДНК в организме) примерного завода Arabidopsis, участника семейства горчицы, с геномом водосбора, отдаленно связанным заводом семейства лютиков.

Филогенетическое дерево (см. число) показывает эволюционные отношения среди (желтого) двудольного растения и однодольное растение (светло синий) разновидности, каковые они изучили. Точки разветвления воображают точки развилки двух разновидностей от общего предка.

У последовательностей совместно между этими двумя фабриками, каковые отличались более чем 130 миллионов лет назад, возможно, будут ответственные функции, либо они были бы утрачены из-за случайных мутаций либо вставок либо удалений.Они нашли более чем 200 CNSs совместно между этими отдаленно связанными разновидностями.

Помимо этого, 59 из этих CNSs были кроме этого отысканы в однодольных растениях, каковые еще более отдаленны эволюционно, и их назвали глубоким CNSs. Наконец, они продемонстрировали, что 51 из них, думается, отысканы во всех цветущих растениях, на базе их происхождения в Amborella, цветущее растение, которое отличалось от всех упомянутых выше фабрик кроме того, перед тем как двудольное растение однодольного растения разделилось (см. число).Так, какова могла быть функция их глубоко CNSs?

Мы можем взять подсказки, разбирая типы генов, с которыми связаны эти CNSs. Исследователи нашли, что практически все глубокие CNSs связаны с генами, вовлеченными в главные и универсальные биологические процессы в цветущих растениях – процессы, такие как развитие, ответ на регулирование и гормоны экспрессии гена. Они нашли, что большая часть этих CNSs связано с генами, вовлеченными в развитие органа и ткани, постэмбриональное дифференцирование, производство и расцвет репродуктивных структур. Другие связаны с гормоном – и солено-отзывчивые гены либо с транскрипционными факторами генетического кода, каковые являются регулирующими белками, каковые руководят экспрессией гена, включая и выключая другие гены.

Помимо этого, они продемонстрировали, что эти CNSs обогащены для связывающих участков для транскрипционных факторов и предлагают, дабы функция части данной некодирующей ДНК действовала как леса для организации оборудования для экспрессии гена. Связывающие участки, каковые они нашли, являются известными последовательностями, вовлеченными в другие фабрики по мере необходимости для ответа на биотическое и неживое напряжение, гормоны и свет.

Помимо этого, они поняли, что большое количество CNSs имели возможность произвести РНК, у которых имеется широкие двухцепочечные регионы. Эти двухцепочечные регионы, как показывали, были вовлечены в стабильность РНК, деградацию, и в регулирование экспрессии гена.

Двенадцать из большинства 59 высоко сохранили CNSs, связаны с генами, продукты белка которых взаимодействуют с РНК. Разумеется, эти последовательности ДНК не просто «барахло

Сейчас, в то время, когда Burgess и Freeling выяснили самый высоко сохраненные некодирующие последовательности ДНК в цветущих растениях, у будущих ученых имеется лучшая мысль что области генома сосредоточиться на для функциональных изучений. Предсказанные связывающие участки транскрипционного фактора в действительности связывают узнаваемые либо новые транскрипционные факторы?

CNSs организуют либо регулируют оборудование для экспрессии гена? CNSs кодируют РНК, каковые регулируют фундаментальные процессы на фабриках?

На ответы на них и большое количество связанных вопросов будет легче ответить сейчас, в то время, когда у нас имеется данный комплект глубоких CNSs, каковые, возможно, будут играться серьёзные роли в главных клеточных процессах на фабриках.

Блог автомобилиста