Исследователи поняли, что целое упорядочивание генома может оказать влияние на лечение пациентов и инфекционный контроль из-за клинических соответствующих данных, каковые это снабжает на бактериальной передаче. В сотрудничестве с исследователями Illumina учеными из Кембриджского университета Университет Wellcome Trust Sanger применял целое упорядочивание генома, дабы установить, что выделяет устойчивого к метицилину золотистого стафилококка (MRSA), была часть стационарной вспышки, поскольку текущие способы лаборатории довольно часто неспособны различать MRSA, выделяет.Новое изучение, изданное в The New England Journal of Medicine, показало, что целое упорядочивание генома может не только скоро снабдить правильными данными, это кроме этого светло различает MRSA, выделяет.
Зараза MRSA есть ведущей проблемой здравоохранения. 2 008 американских оценок говорят о том, что 15 249 смертельных случаев были приписаны 89,785 инвазивным заразам MRSA.
В среднем больные с заразами MRSA тратят в два раза более продолжительно в поликлинике по сравнению с другими больными, вошедшими по тем же обстоятельствам. Более долгие нахождения в поликлинике, плюс лечение, дабы иметь дело с подобными заразами поднимают цена здравоохранения.
Дабы лучше руководить связанной со здравоохранением заразой, это критически к скоро, и совершенно верно идентифицируйте бактериальную передачу.Ведущий исследователь, доктор наук Шарон Пикок, из Кембриджского университета растолковывает:«Ответственное ограничение текущей методике инфекционного контроля – то, что дешёвые бактериальные способы типирования не смогут различать разные штаммы MRSA.
Цель отечественного изучения была в том, чтобы видеть, имело возможность ли бы целое упорядочивание генома MRSA употребляться, дабы различать связанные штаммы на уровне генома, и в случае если это будет информировать и вести расследования вспышки».Исследователи основались собственный изучение вспышки MRSA в новорожденной палате интенсивной терапии, уже закончившейся, взяв образцы и упорядочив их в реальном времени. Они поняли, что целое упорядочивание генома разрешило им различать штаммы, каковые были частью вспышки и тех, каковые не были.
Это показало, что вспышка, быть может, была идентифицирована более скоро если сравнивать с текущим клиническим тестированием, и исходя из этого возможно сокращением размера вспышки.Исследователь Co-продвижения, врач Джеффри Смит, Старший управляющий Изучения в Иллуминой заявил:«Это изучение демонстрирует, как удачи в целом упорядочивании генома смогут дать значительную данные, дабы оказать помощь бороться со стационарными вспышками в клинически соответствующие оборотные времена. Потому, что упорядочивание стало все более и более правильным и всесторонним, оно может употребляться, дабы ответить на широкий спектр вопросов. Кроме того, что мы имели возможность отличить разные штаммы MRSA в поликлинике, мы кроме этого смогли скоро характеризовать устойчивость к антибиотикам, и гены токсина, существующие в клиническом, выделяет».
Команда потом развила перечень всех генов MRSA, заставляющих устойчивость к антибиотикам разрешать стремительную идентификацию устойчивости к лекарству в штаммах MRSA, каковые окажут помощь работникам здравоохранения в лечении каждого зараженного больного с самой адекватной вероятной терапией. Помимо этого, это снабжает замечательный инструмент, дабы найти новые механизмы устойчивости к лекарству.MRSA генерирует разные неповторимые токсины, способные привести к тяжелым клиническим синдромам, таким как септический шок, пневмония, и осложненная инфекции и кожа мягкой ткани.
Исследователи развили перечень генов токсина, дабы скоро идентифицировать эти гены, происходящие в штаммах MRSA. На данный момент эти токсины смогут лишь быть идентифицированы с многократными пробами в справочных лабораториях.Ведущий создатель, врач Джулиан Пархилл от Университета Wellcome Trust Sanger увидел:«Различение штаммов принципиально важно для управления инфекционным контролем. Стремительное воздействие принципиально важно, дабы руководить подозреваемой вспышкой, но оно имеет равное значение, дабы идентифицировать несвязанные штаммы, дабы не допустить ненужные закрытия палаты и другие подрывные меры контроля.
Потребность здравоохранения лучше, более действенные методы идентифицировать вспышку и после этого обрабатывает эти. Текущие клинические способы, дабы вынудить связи между связанными штаммами сравнить структуру бактериальной чувствительности к профилю антибиотиков. Мы нашли, что данный способ был неточен.
Мы идентифицировали два штамма MRSA, каковые, казалось, были аналогичными применяющими текущими способами, генетически весьма отличались».В конечном итоге применение целого упорядочивания генома станет частью простого здравоохранения, и эти результаты изучения сделали вклад, дабы поддержать целое упорядочивание генома в контролировании MRSA и другими вспышками в стационарных параметрах настройки.
Доктор наук Пикок завершил: «Следующая стадия обязана создать интерактивные инструменты, снабжающие автоматизированную интерпретацию последовательности генома и предоставляющие клинически значащую данные работникам совокупности здравоохранения, нужный успех, перед тем как это сможет быть реализовано в клиническую практику».